O Píer de Granéis Líquidos 2, ou PGL-2, começou a ser construído em 2000 e no ano seguinte foi inaugurado;

Em 2001, foi iniciada a construção da segunda etapa do porto interno com a dragagem de mais de 1 milhão e 300 mil m³ de areia, estendendo o canal de navegação em mais 450 metros, onde seria construído o cais 4, com 330 metros. Ainda nesse mesmo ano, os cais 2 e 3 do porto interno foram arrendados pela empresa Tecon Suape;

Para atender à expansão da zona portuária e ao aumento significativo da movimentação de cargas, deu-se início à execução da duplicação da Avenida Portuária, com extensão de 4,4 quilômetros em 2002. Ainda para atender às necessidades da expansão da Zona Portuária, também foi iniciada a construção do primeiro Prédio da Central de Operações Portuárias, que abrigaria as autoridades portuárias operantes em Suape;

Em 2003, o Porto de Suape recebeu da Food and Drug Administration (FDA), vinculada ao governo dos Estados Unidos da América, um certificado internacional que atesta o  atendimento às medidas da lei contra o bioterrorismo;

O Centro de Treinamento do Complexo de Suape foi inaugurado em 2004, com o intuito de promover a inclusão educacional para os moradores do entorno de Suape e para funcionários do complexo;

Em 2005, é lançada a pedra fundamental da Refinaria General José Ignácio Abreu e Lima. Após cerca de 50 anos de lutas, a refinaria chega a Pernambuco;

A empresa italiana Mossi & Ghisolf foi inaugurada em 2006. A M&G opera cinco unidades industriais no Brasil, distribuídas em três estados: São Paulo, Minas Gerais e Pernambuco;

O Estaleiro Atlântico Sul foi inaugurado em 2008, sendo o primeiro empreendimento do Polo Naval de Suape;

O Cais 5 foi inaugurado em 2009. Com 343 metros de comprimento, este cais movimenta, principalmente, cargas gerais e granéis sólidos;

A empresa espanhola do grupo Gonvarri, GRI Towers, chegou em 2009 para produzir torres eólicas;

Uma das principais empresas de agronegócio e alimentos, a Bunge foi inaugurada em no Porto de Suape em 2009, com cerca de R$ 196 milhões em investimentos.